Program studi Magister Teknik Sipil merupakan program studi pascasarjana (S-2) yang kedua di fakultas teknik setelah Program Studi Magister Teknik Energi Terbarukan yang berdiri pada tanggal 5 Oktober 2018. Program Studi ini berdiri pada tanggal 06 Mei 2020, ditetapkan melalui SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI Nomor 511/M/2020.
Program studi Magister Teknik Sipil memiliki hubungan keilmuan yang bersifat sinergitas terutama dengan program studi strata satu Teknik Sipil, Arsitektur, Teknik Lingkungan, Perencanaan Wilayah dan Kota dan Program Studi Ketekniksipilan lainnya. Program Studi ini memiliki ciri khas atau karakteristik khusus pada bidang ilmu perkembangan teknologi dan manajemen rekayasa infrastruktur berkelanjutan berbasis potensi lokal.